Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB5A4FU69 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB5A4FU69 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms