Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms