Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NFE2L3Q9Y4A8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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