Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCAN3Q9UKA8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms