Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms