Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFMBT1Q9UHJ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms