Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms