Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms