Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms