Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA2D2Q9NY47 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms