Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F12Q9HCS2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F12Q9HCS2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms