Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XKR8Q9H6D3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XKR8Q9H6D3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms