Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms