Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRTNQ9H040 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRTNQ9H040 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms