Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms