Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms