Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms