Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSCC1Q9BVC3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms