Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP8Q9BV40 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP8Q9BV40 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP8Q9BV40 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP8Q9BV40 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP8Q9BV40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms