Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms