Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms