Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms