Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL15Q96M94 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL15Q96M94 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms