Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF4Q96M43 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF4Q96M43 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms