Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms