Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIC2Q96JB3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms