Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms