Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms