Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRAT1Q92837 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms