Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms