Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms