Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms