Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms