Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms