Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPN12Q6ZSI9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms