Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COLCA1Q6ZS62 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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