Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms