Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN13Q6MZZ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPN13Q6MZZ7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms