Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms