Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR44Q5JSH3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms