Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms