Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms