Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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