Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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