Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLFQ16534 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLFQ16534 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLFQ16534 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLFQ16534 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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