Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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