Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3CQ15386 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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