Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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