Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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