Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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CKAP5Q14008 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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